Tiga puluh tahun yang lalu, benua Eurasia dihancurkan oleh "gempa spasial" supermasif—fenomena yang melibatkan getaran ruang angkasa yang asalnya tidak diketahui—yang mengakibatkan kematian lebih dari 150 juta orang. Sejak saat itu, gempa-gempa ini sesekali mengganggu dunia, meskipun dalam skala yang lebih ringan. Shidou Itsuka adalah siswa SMA biasa yang tinggal bersama adik perempuannya, Kotori. Ketika gempa spasial mengancam keselamatan Kota Tengu, ia bergegas untuk menyelamatkannya, hanya untuk terjebak dalam letusan yang dihasilkan. Dia menemukan seorang gadis misterius di sumbernya, yang diturunkan menjadi "Roh", entitas dunia lain yang penampilannya memicu gempa spasial. Segera setelah itu, dia terlibat dalam pertempuran kecil antara gadis itu dan Tim Anti-Spirit, pasukan penyerang yang kejam dengan tujuan memusnahkan Spirit. Namun, ada pihak ketiga yang percaya menyelamatkan roh: "Ratatoskr," yang secara mengejutkan diperintahkan oleh adik perempuan Shidou! Kotori secara paksa merekrut Shidou setelah bentrokan, memberinya metode alternatif untuk menghadapi bahaya yang ditimbulkan oleh para Spirit—membuat mereka jatuh cinta padanya. Sekarang, nasib dunia bergantung pada kehebatannya dalam berkencan, saat dia mencari Spirit untuk memikat mereka.
